更新時間:2025-11-16 20:35:55作者:佚名
要使用fMRIPrepbids是什么意思,bids的發(fā)音_bids翻譯,去知悉BIDS格式相當關鍵,BIDS稱作Brain Imaging Data Structure,其目的在于給神經影像數據的組織以及共享給出統(tǒng)一的標準格式,在數據處于雜亂且難以辨認的狀況下,BIDS格式能夠明顯簡化數據管理流程,躲開了老是去問數據來源者來確認文件結構的繁復過程。
采用BIDS格式的優(yōu)勢包括:
以下是改寫后的內容:BIDS格式給出了一套標準化的文件命名規(guī)則,其用于存儲不一樣類型的神經影像數據,這里面有T1加權圖像,還有靜息態(tài)功能磁共振成像,也就是fMRI,以及任務態(tài)fMRI,還有彌散加權成像,也就是dMRI。比如說,用“sub-001_ses-pre_T1.json/nii”表述3D T1加權圖像,或者用“sub-001_ses-pre_task-nback_bold.json/nii”表述任務態(tài)fMRI。
2. 參數加以區(qū)分:針對有著相同模態(tài)然而參數不一樣的數據,借助于在文件名里增添參數描述,就像“sub-001_ses-pre_task-nback_acq-TR1400_bold.json/nii”,這代表著TR1400參數,以此來保證數據能夠被準確區(qū)分。
3.關于文件組織,要是數據集僅僅只涵蓋單次會話,那么就能夠省略“ses-”這個前綴,就像“sub-001_task-rest_bold.json/nii”這樣。而任務數據的詳細描述應當被存放在對應subject目錄下面的tsv文件當中。
于構建BIDS數據集之后,能夠借助BIDS Validator予以驗證,以此保證數據集的結構契合標準,除此之外bids是什么意思,bids的發(fā)音_bids翻譯,BIDS官網給出了更多詳盡信息,涵蓋了除MRI數據之外的其他類型數據存儲以及不同模態(tài)的細節(jié)問題 。
可參照一份由fMRIPrep實驗室給出的使用教程來更好地踐行BIDS格式,該教程涵蓋手動及代碼操作方式。雖然代碼示例是基于公開數據,不過或許得加以調整以契合具體項目要求。我曾經編寫了一個腳本,用于把單次會話的T1、靜息態(tài)fMRI以及dMRI數據整理成BIDS格式起步網校,并且已在GitHub上開源,供個人與團隊使用。在使用期間倘若碰到任何問題,歡迎隨時交流并給予反饋。